Die Arbeitsschwerpunkte liegen in allen Fachbereichen der Almwirtschaft in der Betreuung mehrerer Bezirke Tirols sowie als Projektant und landwirtschaftlicher Sachverständiger für verschiedene Behörden, Gerichte und Privatpersonen.
Innovative, fachübergreifende Waldweideneuordnungen (Servitutenneuregulierungen) wurden von ihm seit dem Jahr 1992 im Tiroler Unterland entwickelt und als Operationsleiter durchgeführt, dutzende Fachexkursionen begleitet.
Bei der Teilnahme an interdisziplinären Projekten wie dem dreijährigen EGAR-Projekt (Einzugsgebiete alpiner Regionen), dem WLV-Projekt Pertisauer Wildbäche oder dem dreijährigen österreichweiten Projekt Alp Austria (Programm zur Sicherung und Entwicklung der alpinen Kulturlandschaft) konnte Franz Legner die Vernetzungen aller Fachbereiche in der Bergregion kennenlernen, alm- und landwirtschaftliches Wissen anwenden und Kooperationsbereitschaft beweisen.
Seit dem Jahr 1999 hält DI Franz Legner die Vorlesung Alpwirtschaft (Alpwirtschaft.com) auf der Universität für Bodenkultur in Wien. Speziell für Studenten des Bakkalaureatsstudiums "Umwelt- und Bioressourcenmanagement" wird seit dem Sommersemester 2006 zusätzlich die Pflichtvorlesung Nachhaltige Bergraumbewirtschaftung vorgetragen.
Im Herbst 2005 absolvierte Franz Legner die Prüfung zum allgemein beeideten und gerichtlich zertifizierten Sachverständigen, am 1. März 2006 wurde er im Landesgericht Innsbruck vereidigt.